12月25 這一年,百邁客云平臺的華麗麗麗麗大變身 ——做科研,我們是認真的
彈指一揮間,2017年轉眼就到了要跟大家告別的時刻,在上一期的年終大盤點中跟大家分享了百邁客云平臺用戶的傲人成績,在累累碩果的背后,一直有著一群兢兢業(yè)業(yè)的生信人,這一年里,他們是根據廣大用戶的體驗反饋,不斷改進,不斷更新,使咱們的云平臺來了一場華麗麗的大變身。細數這一年,云平臺總共更新53次,更新項目達200多個,包括新主流程的上線,頁面版塊的調整,分析功能的完善,數據庫的改進,平臺速度的提升等。每一次改進都是為了使云平臺的用戶有一個更好的分析體驗,每一次更新都希望用戶可以有更高效的科研產出。今天,咱們一起來瞅瞅百邁客云平臺17年到底有哪些大變樣。
2017全新上線篇
“讓基因分析更簡單”是百邁客云平臺前進的不竭動力,相信大家最關心的應該是云平臺這一年有哪些新的分析流程上線。
2017
4/14??云平臺上線lncRNA v3.0主流程;
4/21??全基因組關聯(GWAS)分析平臺(Beta版,云服務個性化)正式上線;
6/9???BSA 分析平臺 v1.0(Beta版,云服務個性化)正式上線;
9/22??全基因組重測序分析平臺3.0正式上線。做lncRNA,GWAS,BSA,全基因組重測序分析的用戶有福啦!
另外,早在2017年3月3日,咱們云平臺的云組第一期已正式上線,實現了組內成員計算、存儲、工具的資源共享等功能,一個課題組的成員們可以同時享用同一個分析平臺,再也不用為互傳數據和結果而煩憂;
2017年6月30日 ,移動端微信公眾號全新改版,在百邁客云微信公眾號中添加文獻檢索、文獻解讀、文獻收藏、云賬號綁定、項目進展查看和評價等功能,同期,在線支付功能上線,套餐用戶支持使用支付寶、微信在線購買分析平臺、小工具,收貨地址與個人信息關聯,用戶可以在線填寫發(fā)票信息。
APP主流程更新篇
這么多新的APP成功上線了,顯然是一件值得慶賀的事情,無獨有偶,咱們已經在線上的APP也從來沒有停止前進的步伐。
2017
1/20??無參轉錄組分析APP進行了全面更新還實現了圖片和基因之間的交互,新增“WGCNA”個性化工具,新增基因結構挖掘功能等功能;
3/3??微生物多樣性分析APP更新至2.0版,新增6項分析內容;并且美化了流程中各步驟生成的圖片,確保所有圖形結果有png圖和矢量圖等功能;
3/17??微生物多樣性分析APP再次更新:增加5個個性化分析內容;同期,小RNA測序分析APP也進行了20多項更新:增加小RNA所對應的染色體、起始點、終止點信息和miRNA對應的前體位置信息,支持更加精細化的檢索,添加一鍵繪圖等功能;
3/26??微生物多樣性分析APP更新了引導教程圖片;
6/16??微生物多樣性分析APP進行了功能更新:基本分析和個性化中RDA/CCA環(huán)境因子支持文件上傳,增加保存歷史參數功能等;
7/7??ChIP-Seq 分析APP的基本分析,增加了Input/IP設置,且支持有生物學重復的差異分析等功能;
7/21??真核生物有參/無參分析APP個性化分析進行了更新:基因挖掘中相應添加eggNOG分類圖、KEGG分類圖、KEGG富集圖、GO富集圖、MA圖和火山圖等;
7/28??真核生物有參/無參分析APP個性化添加差異分組時增加Pvalue選項;
8/25??lncRNA分析APP進行了20多項的更新:新增圖片交互功能,增加火山圖、MA圖,增加矢量圖, Readme.pdf文件,WGCNA分析等;
9/1??微生物多樣性分析APP個性化更新,增加21個個性化且每個個性化都有多個參數可以調整分析;
12/1??微生物多樣性APP第四期更新:對OTU個數分布圖、物種分布柱狀圖、PCA分析等15項進行了優(yōu)化。
極速體驗更新篇
為了方便用戶能夠在短時間內體驗到云平臺的標準分析和個性化分析內容,研發(fā)人員特意準備了極速體驗項目,標準分析在兩分鐘內得到結題報告,隨后即可進入個性化分析流程。
2017
3/31??有參、無參、表達譜,小RNA,四個分析平臺更新了極速體驗項目,增加示例數據;
6/30??群體三個分析平臺(BSA、全基因組關聯、基于第二代測序標記的遺傳圖譜)增加極速體驗功能。目前已有極速體驗的分析平臺包括:真核生物有參轉錄組分析平臺、真核生物無參轉錄組分析平臺、小RNA測序分析平臺、LncRNA測序分析平臺、微生物多樣性分析平臺、數字基因表達譜分析平臺、醫(yī)學有參轉錄組分析平臺、外顯子組測序分析平臺。
是不是要為咱們的研發(fā)人員打個call?
云課堂更新篇
百邁客云課堂,絕對是您科研路上的好幫手。2017年百邁客云課堂先后共進行了5次更新,現在的云課堂集185+線上培訓課程于一體,囊括RNA系列、DNA系列、生物信息軟件使用和大家講壇等課程,針對分析平臺每款APP都有詳細說明及步驟提示,無論有沒有生物信息學基礎,都能幫助用戶在短期內玩轉各類分析。
數據庫更新篇
整合利用公共數據發(fā)表論文是近年來的研究熱點,2017年百邁客云平臺數據庫先后更新9次,包含8大數據庫、12PB公共數據、373萬樣本,共收錄826個參考基因組、2000+種醫(yī)學數據、306萬互作網絡關系、1700萬基因、8億變異數據。
小工具更新篇
2017年云平臺小工具先后更新了4次,包含PCA分析、WGCNA分析、轉錄因子預測、遺傳共線性分析、GO富集分析、聚類熱圖、柱狀圖、點線圖、miRNA基因家族分類等104款小工具和3大工具集,覆蓋12大功能類別:基因分析、遺傳進化、ncRNA、質控、組裝、比對、數據提取、突變、統(tǒng)計、表格處理、繪圖、序列分析等。
文獻功能更新篇
2017年云平臺對文獻模塊先后進行了3次更新,如今查找文獻和數據導入都非常方便,共整合了2700+萬篇文獻,同步NCBI數據,設置多項過濾欄,方便快速查找,還可輕松獲得全文解讀,文章數據可一鍵導入分析。
云平臺其他功能更新篇
2017
3/10?云平臺建立項目進展查詢機制,用戶通過云平臺可以及時了解項目進度,增加項目線上評價功能,用戶可以在線對項目各個維度的服務進行評價,我們可以通過評價提升項目服務質量,以及對頁面內容進行整理更新,使項目的管理更清晰;
4/10??云平臺結題報告進行全面優(yōu)化,包括加載速度和流暢度,右側導航可以智能展開和收起,圖片可調大,添加專有名詞解釋;
5/19??Venn圖支持多個區(qū)域選擇,WGCNA添加分類模塊功能富集結果圖的展示,轉錄因子支持動物物種的預測,有參支持按照指定基因名稱替換;
5/26??云科技官網上線文獻檢索、功能基因數據庫和學術課堂功能,不用登陸即可體驗超強功能;
7/14??真核有參、小RNA測序、微生物多樣性、ChIP-Seq分析平臺增加pdf格式結題報告下載功能;
7/21??云平臺登錄支持第三方微信便捷登錄;
9/22??為了用戶在體驗過程中的流暢度,在平臺登錄頁面添加了瀏覽器使用建議。貼心無處不在~
告別成績斐然的2017,迎來了充滿希望的2018,我們堅信新的一年百邁客云平臺(BMKCloud)一定會再創(chuàng)輝煌,為廣大用戶提供一個更加完美的數據分析平臺。作為一個生物大數據分析的開放云平臺,擁有龐大的專業(yè)用戶群和開發(fā)者用戶群(15000+),為用戶提供完整的生物信息分析以及整合利用公共數據的解決方案,我們一直在努力!